保税港区是指经国务院批准设立的，在港口作业区和与之相连的特定区域内，集港口作业、物流和加工为一体，具有口岸功能的海关特殊监管区。保税港区被称为我国目前开放层次最高、政策最优惠、功能最齐全的特殊区域，是国家实施自由贸易区战略的先行试验区。
国家赋予保税港区的主要税收政策为：国外货物入港区保税；货物出港区进入国内销售按货物进口的有关规定办理报关，并按货物实际状态征税；国内货物入港区视同出口，实行退税；港区内企业之间的货物交易不征收增值税和消费税。保税港区叠加了保税区、出口加工区和保税物流园区的税收和外汇政策，在区位、功能和政策上具有优势。
随着我国改革开放的不断推进，沿海港口城市经历了从保税区、出口加工区、保税物流园区到保税港区的演进。“功能的整合和政策的叠加”趋势越来越明显，保税港区就叠加了口岸、物流、加工等功能，是保税区的高级形态，拥有仓储物流、对外贸易、国际采购、分销和配送、国际中转、检测和售后服务维修，以及商品展示、研发、加工、制造、港口作业等功能，是新一轮开放型经济向深度和广度推进的重要支撑。
从2005年6月上海洋山设立第一个国家级保税港区至今，七个国家级保税港区相继设立，可以清晰地看出沿海地区开放布局充分考虑了对区域经济的带动。如果说上海、天津、大连、海南这四个保税港区的设立是“各自为战”，那么今年宁波、钦州、厦门保税港区的设立则有“协同作战”的意味。